Lato 1998

Główna bohaterka Lain Iwakura, wycofana dziewczyna której życie zostaje zmienione przez tajemniczego e-maila, którego nadawcą jest Chisa Yomoda. Co w tym dziwnego? Otóż Chisa nie żyje… Popełniła samobójstwo skacząc z dachu. W treści e-maila informuje Lain, że nadal istnieje i tylko porzuciła swoje ciało. Głupi żart, czy szczera prawda? Lain Iwakura postanawia to sprawdzić. Prosi ojca, o nowego Navi (rodzaj futurystycznego komputera) i dzięki temu zyskuje swobodny dostęp do Wired (wielkiej sieci informacyjnej). Wraz ze zgłębianiem zasobów Wired poprawiają się jej stosunki z koleżankami – zaczyna wychodzić z nimi do klubu Cyberia i na zakupy. Niestety granica pomiędzy rzeczywistością, a wirtualną przestrzenią Wired niebezpiecznie zaciera się… A Lain zaczyna mieć obsesję na punkcie Wired. Nic nie jest tym, czym było wcześniej… Kim jest Lain? Kim była w przeszłości i jak wpłynie to na jej przyszłość? Kim są Knights? I najważniejsze… Czy Wired to świat nadrzędny, czy podlegający rzeczywistości? Chcąc odnaleźć odpowiedzi musicie wkroczyć w świat bohaterki anime.