W roku 2027 w Akademii Seiga panuje moda na grę Phantasy Star Online 2. Każdy uczeń jest fanem tej gry – z wyjątkiem Itsuki Tachibany, dobrze ułożonego ucznia, który nie gra w gry wideo. Ze względu na swoją popularność, gra jest obecnie badana w Akademii Seiga, aby sprawdzić, czy ma negatywny wpływ na uczniów. Konsekwencje powodują, że Itsuki przyciąga uwagę Riny Izumi, perfekcjonistycznej przewodniczącej rady uczniowskiej, która chce udowodnić, że gra nie jest niczemu winna.
Aby osiągnąć swój cel, Rina zatrudnia Itsukiego jako wiceprzewodniczącego rady uczniowskiej i stawia przed nim zadanie nauczenia się gry przy jednoczesnym utrzymaniu dobrych ocen. Teraz Itsuki jest zobowiązany do relacjonowania Rinie swoich codziennych odkryć w grze i analizowania jej zalet, a los Phantasy Star Online 2 spoczywa w jego rękach.