„Pomagajmy sobie nawzajem i dążmy do tego, by stać się idealnymi zwykłymi uczniami”.
Kobato, który kiedyś miał gorzkie doświadczenia związane z działaniami dedukcyjnymi znanymi jako „praca nad mądrością”, był zdeterminowany, by stać się uczciwym i pokornym studentem. Potajemnie nawiązał wzajemną relację ze swoim kolegą z klasy, Osanai, który podzielał te same aspiracje, planując zadebiutować w liceum jako zwykli uczniowie i wieść spokojne dni. Jednak z jakiegoś powodu tajemnicze incydenty i nieszczęścia pojawiają się jeden po drugim w ich szkolnym życiu. Czy Kobato i Osanai będą w stanie spędzić spokojne dni jako zwykli uczniowie?