Shuuzou “Shuu” Matsutani prowadzi spokojne i normalne życie. Otacza się przyjaciółmi, miłością oraz posiada pasje do kendo. Zniechęcony po przegranej ze swoim rywalem w kendo, Shuu wspina się na komin, aby obejrzeć zachód słońca, gdzie znajduje Lala-Ru – cichą, niebieskowłosą dziewczynę, która ma dziwny wisiorek. Shuu próbuje się z nią zaprzyjaźnić, pomimo jej bezinteresownych oraz nijakich odpowiedzi.
Jednak jego nadzieja zostaje zniszczona w momencie, jak kobieta w towarzystwie dwóch maszyn niespodziewanie pojawia się mając jeden cel: schwytać Lala-Ru. Shuu próbuje uratować swoją nową przyjaciółkę przed porywaczami. Niestety nie udaje mu się, a dodatkowo zostaje przeniesiony do pustynnego świata, którego nigdy wcześniej nie widział. Jednak mimo okoliczności, Shuu myśli tylko o uratowaniu Lala-Ru do momentu, gdy zostaje pobity przez żołnierz. Wkrótce dowiaduje się, że Lala-Ru potrafi manipulować wodą, a jej wisiorek jest źródłem jej mocy. Niestety jej wisiorek ginie w nieznanych okolicznościach, a Shuu jest podejrzany o jego kradzież.
Ima, Soko ni Iru Boku to historia dystopijnego świata, w którym Shuu musi znosić tortury, głód i okropności wojny, aby uratować samotną dziewczynę, którą znalazł siedzącą na szczycie komina.