Japoński Związek Piłki Nożnej po przemyśleniu stanu dyscypliny w kraju zdecydował się na zatrudnienie tajemniczego i ekscentrycznego trenera, Jinpachiego Ego, by osiągnąć marzenie o zdobyciu Pucharu Świata. Wierząc, że Japonii brakuje głodnego goli, egoistycznego napastnika, Jinpachi inicjuje Blue Lock, przypominający więzienie ośrodek, w którym odizolowanych i postawionych przeciw sobie zostaje 300 napastników z japońskich szkół średnich. Ten, który przetrwa, zostanie napastnikiem reprezentacji kraju, podczas gdy pozostali zostaną z niej dożywotnio wykluczeni.
Wśród wybranych znajduje się Yoichi Isagi, napastnik, który nie zdołał wprowadzić swojej licealnej drużyny do finałów krajowych. Odkąd zamiast samemu strzelić bramkę, podał do kolegi, który spudłował, nie może przestać się zastanawiać, czy wynik byłby inny, gdyby tylko był bardziej egoistyczny. Korzystając z szansy, którą dał mu projekt Blue Lock, Yoichi zamierza pozbyć się wątpliwości i podążyć za swym największym pragnieniem - stać się najlepszym napastnikiem na świecie i poprowadzić Japonię do chwały na Mistrzostwach Świata.
